Både i krig og i fredstid har Forsvaret brug for geodata til at løse sine mange opgaver. Klimadatastyrelsen indgår i et tæt samarbejde med Forsvarsministeriet, Materiel- og Indkøbsstyrelsen (FMI) om at levere de nødvendige data og kort.
Samarbejdsaftalen mellem FMI og Klimadatastyrelsen går mange år tilbage. Klimadatastyrelsen leverer både data og kortprodukter samt geofaglig rådgivning til Forsvaret. Der er både tale om faste standardiserede produkter og om skræddersyede produkter tilpasset specifikke behov
Aftalen er kendetegnet ved stor fleksibilitet, og Klimadatastyrelsen kan hurtigt levere nye data og kort, som understøtter Forsvaret strategisk og operationelt i en hastigt foranderlig verden.
Konkret indebærer samarbejdet blandt andet, at Klimadatastyrelsen producerer landkort, flyvekort og andre geodata over Rigsfællesskabet samt løser specialopgaver i såvel dansk som internationalt område.
Derudover omfatter aftalen geofaglig rådgivning, kompetenceudvikling, undervisning samt deltagelse i nationale og internationale arbejdsgrupper på vegne af Forsvaret. Et vigtigt element heri er arbejdet med standardisering.
Da Klimadatastyrelsen i 2018-2022 foretog en omfattende nykortlægning af Grønland, skete det også i samarbejde med FMI.